首先碘酊和碘伏成分不同。碘酊是一种酊剂（碘化钾溶解在酒精里），而碘伏是碘和聚乙烯吡咯烷酮的络合物。聚乙烯吡咯烷酮是一种表面活性剂，可以将单质碘溶解其中也起到增溶的作用，碘伏不含有酒精。
碘酊和碘伏适应症不同。碘酊含有酒精，因此不能直接用于擦拭破损的皮肤，也不能用于口腔黏膜等，会有刺激性痛感，酒精会扩张毛细血管，不利于伤口周围毛细血管收缩止血，延缓伤口愈合速度，造成感染几率增加。10%的碘酊溶液常用于外科手术的消毒，当用碘酊手术消毒时，擦拭碘酊后要等擦拭部位干了之后再用70%的酒精脱碘；碘伏不含有酒精，刺激性小，可用于皮肤直接消毒，也可用于破损皮肤的消毒，还用于外科手术消毒，碘伏经过稀释后可以用于口腔炎漱口。
笔者在其中一个规模场也做了对比试验，一栋产房有61头母猪，31头母猪的209头小公猪阉割用碘伏消毒，30头母猪产的198头小公猪用碘酊消毒，阉割工作在分娩后第五天进行，并且由同一名熟练的 技术 员进行的操作，试验数据如下：
从试验中可以看出，两个试验组虽然都有出血的情况，但是使用碘酊组出血率高达27.3%，比碘伏组高了24.9%。阉割手术后第二天碘酊组红肿率15.7%，比碘伏组高13.8%。所以在给猪进行伤口消毒的时候要选择合适的消毒药，让猪只更快的恢复健康。
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